안녕하세요 대학원생 정입니다.정말 오랜만에 글을 올리는 것 같아요.:)
그동안 수많은 일로 주기적인 포스팅을 하지 못했는데 지금은 조금씩 시간적 여유가 생겨 조금씩 시간이 날 때 포스팅을 하려고 합니다.
오늘은 통계 프로그램 중 하나인 Prism 9.0 버전에 대해 알아보도록 하겠습니다.
통계는 문, 이과 연구를 불문하고 각 변수 간의 차이를 비교하는 데 많이 사용되고 있습니다.간단히 말해서 각 변수들 간의 통계적 유의성이 있는지를 확인하는 것이라고 보시면 됩니다.:)
통계적 유의성이 있다는 것은 대조군과 비교군(실험군)에 차이가 있다는 것이고 통계적 유의성이 없다는 것은 대조군과 비교군(실험군)에 차이가 없다는 뜻으로 각 연구 종류에 따라 통계적 유의성이 있어야 하거나 없어야 합니다.
저희 연구실의 경우 invitro, invivo에서 독성의 발현 정도, 메인 약물과 부스터 역할을 하는 약물을 함께 투여한 경우 약물의 정량차이, 용량 의존적으로 직선성이 있는지에 대해 통계적 유의성 여부를 확인하고 있습니다.
이때 사용하는 통계 프로그램이 GraphPadPrism9.0입니다.
저희 연구실의 경우 대부분 AVONA, T-test로 통계를 내기 때문에 위의 두 가지 설정으로 설명하겠습니다.:)
0. 통계 프로그램을 클릭하여 바로 표시되는 화면
위 화면은 통계 프로그램을 클릭하면 바로 보이는 화면입니다.
먼저 왼쪽에 있는 Column을 클릭한 다음(1번) ‘Datatable’에서 ‘start with sample data followatorial’을 클릭합니다. (2번)
3번의 경우 ANOVA, T-test 등 자신이 원하는 통계처리 방법에 맞게 선택해주세요! *3-1: 대조군(Control군), 비교군(실험군) 두 군에 대한 통계분석을 하고자 하는 경우 →T-test*3-2: 3개 군 이상을 한번에 통계분석하고 싶은 경우 →ANOVAtest
자신이 원하는 테스트를 선택한 후 오른쪽 하단에 있는 ‘Create’를 클릭합니다.:)
< T-test를 사용하는 경우 >
- 검은색으로 칠한 곳에 내가 비교하는 너희들에 대한 정보를 넣습니다.
2. 비교할 내용을 적절히 입력한 모습 (예 적용)
3. 왼쪽 상단의 “Insert”를 클릭한 후 “New Analysis..”를 클릭합니다.
4. 그러면 처음에 설정한 통계 방법에 대한 정보 및 통계 분석군을 확인할 수 있습니다.
-1: 처음 프로그램을 켰을 경우 어떤 통계 방법을 사용할지 선택한 것과 동일한 정보보다 적혀 있는 위치 만약 프로그램을 켠 후 잘못된 통계 방법을 선택한 경우 여기서 다시 선택할 수 있습니다.예) t-test로 했어야 했는데 잘못해서 ANOVA로 선택했다면 여기서 다시 T-test로 수정해주면 끝! 하지만 Table 제목은 바꿀 수 없으니 참고해주세요. 🙂
- 2: 어떤 군을 선택할지 선택하는 곳 t-test의 경우 군이 2개밖에 없으므로 모두 선택해 주십시오.
그런 다음 3번을 클릭하면
위의 그림과 같이 통계분석이 들어가기 전에 설정한 T-test에 대한 그림이 보입니다.
5. 그 후 위에 있는 ‘Options’를 클릭합니다.
6. 여기서 무엇을 대조군(control군)으로 할 것인지를 설정합니다.
A-B 중 A가 대조군(Control군), B가 실험군 저하는 IV군을 대조군(Control군)으로 실험했기 때문에 ‘IV(2mg/kg)-PO(5mg/kg)로 선택하고 아래에 있는 ‘OK’를 클릭합니다.
7. OK 누르면 위 화면과 같이 통계 처리된 표가 나옵니다.
따라서 IV군과 PO군의 반감기를 비교했을 때 p-value가 0.0003으로 통계적으로 유의미한 결과임을 확인할 수 있었습니다. (참고. p-value값이 낮을수록 유의성이 높다, 즉 각 변수를 비교했을 때 그 차이가 크다는 것! 또한 p-value가 낮을수록 *표시가 많아집니다.)
이렇게 수치로 통계적 유의성 여부를 판단할 수 있는데 그래프로 그려보는 것이 더 눈에 띄겠죠?
<그래프 만드는 법>
왼쪽 라인을 보시면 아까 통계처리한 데이터를 그래프로도 그릴 수 있습니다.클릭 후 상황에 맞는 그래프를 선택하여 사용하십시오.:) 저의 경우 맨 아래 그림과 같이 막대 그래프를 선택해서 그려주었습니다.
그리고 통계적 유의성이 있다는 것을 표시하기 위해서 상단에 있는 아이콘을 클릭하여 p-value를 삽입하면…!
타라안…! 이렇게 p-value에 의해 *로 표시되는 것을 볼 수 있습니다.
오늘은 이렇게 통계 분석 프로그램의 하나인 GraphPadPrism 9.0을 이용해서 T-test를 확인하는 방법에 대해서 알아봤습니다.
어떠셨나요?자칭 동알못이 저도 쉽게 사용할 수 있도록 정리한 내용이라 통계에 동글자도 모르는 이웃분들도 잘 사용하실 수 있을 것 같습니다.:)
다음 포스팅은 T-test에 이어 ANOV Atest에 대해 알아볼 예정이니,
통계 프로그램에 미숙한 이웃들은 다음 게시물도 큰 도움이 될 것이라고 믿고 있습니다:)
그럼 다음 포스팅에서 만나요 🙂